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成都(dōu)市青白江區金屬回收廠家電話(huà)13981937861,讓“生命天書”更具全(quán)球代表性 人類(lèi)泛基因組首個草圖發布

發(fā)布時間:2023-05-30 03:23:42

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  人類泛基因組的研究進(jìn)展有助於促進全球醫療公平。泛基因組吸納了更多(duō)不發達地(dì)區人類(lèi)個體的樣本,這意味著它比參(cān)考基因組更適用於研究和輔助應對這些人群(qún)的疾(jí)病。

  ——金(jīn)鑫 深圳華(huá)大生命科學研究院副院長

  5月(yuè)10日,國際學術刊物《自然》發表了人類泛基因組參考序列的階段性成果,在與之(zhī)相關的3篇論文當中,人類泛(fàn)基因組參考聯盟提出(chū)了首個(gè)人類泛基因組參考草圖,以及兩個以(yǐ)這一參(cān)考圖為(wéi)基礎的新遺傳學研究發現。

  自20世紀末啟動以來,人類基因組測序一直是國際遺傳學界最(zuì)關注(zhù)的工程之一。人類基因組計劃中國項目負責人、中(zhōng)科院院士楊煥明曾說,人類基因(yīn)組計劃之所以引人注目,首(shǒu)先源於人們對健康(kāng)的需求。如果能夠(gòu)解碼紛繁(fán)複雜的DNA序(xù)列,人類對(duì)於演化、醫療的(de)理解將(jiāng)更上(shàng)一層樓。人類基因組因此有了“生命天書”的稱號。

  2001年2月(yuè)12日,國際人類基因組計劃首次公布人類基(jī)因組(zǔ)圖譜及(jí)初步分析結果;2003年4月15日,人類基因組序(xù)列(liè)草圖正式公布。在之後的(de)20年中,人類基因組測序工作持續推進(jìn),並不斷取(qǔ)得階段性成果。其中一(yī)些意義比較重大的階段性成果,被(bèi)人們稱為“裏程碑”。

  今年5月(yuè)新(xīn)發(fā)布的首個人(rén)類泛(fàn)基因組參考草(cǎo)圖(tú)也是這樣的“裏程碑(bēi)”成果。深圳(zhèn)華大(dà)生(shēng)命科學研究院副院長金鑫解讀說(shuō),這一成果的重大意義體現在“泛”字當中——這份(fèn)“泛”草圖(tú)意味著空前的多樣(yàng)性,比(bǐ)起原先的參考基因組序列(liè),它具有更好的全球代表性。

  生命(mìng)科學(xué)的(de)“登月計劃”隻是(shì)起點

  基因組測序是遺傳學界的一個重要研究方向,眾(zhòng)多科研團隊圍繞不同目(mù)標製訂(dìng)了許多測(cè)序計劃,其中最核心的(de)是國際人類基因組計劃,該計(jì)劃於2001年2月12日首次公布了人類(lèi)基因(yīn)組圖譜及初(chū)步分析(xī)結(jié)果。

  人類基(jī)因組計劃是一(yī)項規模宏大的跨國科學工程,旨在測定組成人類染色體的(de)30億個堿基對的核苷酸序列,從而繪製人類基因組圖譜,並(bìng)辨識其載有的(de)基(jī)因及其序列,達到破譯人類遺傳信息的最終目的。

  該計劃於1985年提出,來自美、英、法、德、日和中國六(liù)國的(de)2000多名科學家共同參與了這一浩大工(gōng)程,在測序技術尚且不發達的情況下,科學(xué)家曆時十餘年發表了人類(lèi)基因組工作草(cǎo)圖。

  “可以說,人類(lèi)參考基(jī)因組是生命科學(xué)領域最重要的‘基礎設(shè)施’之一,許多生物學(xué)和醫學(xué)領域的突破性研究都基於此產生。”金鑫說。

  但是,這份(fèn)“千呼萬喚始出來”的工作草圖依然缺失大量(liàng)難以測定(dìng)的片段,準確性也受限於時代條件。因此,在之後的20餘年中,這份圖譜經(jīng)曆了數次重大“升級”。

  2003年4月15日,人類基因組序列草圖正式(shì)公布。2013年,參考基因組序(xù)列(GRCh38)正式發布。2022年4月,第一個(gè)完整(zhěng)的、無間隙的人類基因組序列問世,標誌著(zhe)人類“生命天書”首次被完整寫成。

  人類基(jī)因組計劃與“曼(màn)哈頓原子彈計劃(huá)”和(hé)“阿波羅計劃”並稱為(wéi)三大科學計劃,被譽為生命科學領域的“登月計劃”——人類基因組(zǔ)工作草圖的完成就像(xiàng)是人類(lèi)初次登上月球,取得這一(yī)成就需要大(dà)量付出,但(dàn)它依然隻是科學探索(suǒ)的起點而非終點。

  金鑫表示,人類參考(kǎo)基(jī)因組就像是大樹(shù)的主幹,是一切後續研究的基礎,但它並不完(wán)美,依然存在局限性。科學家圍繞這一主幹開展了許多“添枝(zhī)加葉”的工作,泛基因組就是其(qí)中之一。

  泛(fàn)基因組樣本擴大

  人類(lèi)參考基因組是人類遺傳學中使(shǐ)用最廣泛的資(zī)源。但是,它目前的結構是20多人基因的合並單倍型的線性組合(hé),其中,來自歐洲人種(zhǒng)的單個個體提供了大部分序列。

  盡(jìn)管全世界人類的絕大多數遺傳物質都是相同(tóng)的(de),隻有少數基因決定了個(gè)體差異,但是相對單一的樣本意味著人們依然對這些創造差異的基因(yīn)缺乏洞察,因此現有的人類參考(kǎo)基因組無(wú)法完全代表全球人類(lèi)。

  此外,由於人類基因當中存在結構變異和替(tì)代等位基(jī)因,人類參考基因組更加(jiā)無法涵蓋人類物種的遺傳多樣性。金鑫把人類參考基因組的局限(xiàn)性歸納為兩方麵,一是完整性不(bú)足,二(èr)是代表性不足。2022年,完整無間隙基因組序列的誕生很大程度上(shàng)改善了完整性不足的問題,但是參考基因組(zǔ)的代表性仍未(wèi)得到充(chōng)分(fèn)提高。

  為了讓(ràng)基因(yīn)測序具有全球代表性,人類泛基因組參(cān)考聯盟(méng)應運而生,這個組織的宗旨是構建高質量的人類參考基因組。目前,人類泛基因組參考(kǎo)聯盟的目標是以350人的樣本為(wéi)基礎,創建一個質量高、完整度高、準確度(dù)高的基因組,這350人來自世界(jiè)各(gè)地,可以代表人類95%以上的遺傳多樣性。

  今年5月發布的(de)新研究進(jìn)展就是這一計劃的階段(duàn)性成果。目前,研究(jiū)者(zhě)組合了(le)47個個體的遺(yí)傳物質,為原有的參考人類基因組(GRCh38)添加了1.19億堿基對和1115個基因重(chóng)複。

  “相對於主要基於(yú)歐洲人種遺傳物(wù)質建(jiàn)立的(de)參考基因組,泛基因組把樣本擴大到了來自世界各地的(de)人類個(gè)體,具有更好的全球代表性。對於歐美白人(rén)以(yǐ)外的廣大人群,這項工作的意義舉足輕重。”金鑫說。

  將更好為人類健康服務

  相(xiàng)比人類參考(kǎo)基因組(zǔ),5月新發布的泛基因組檢測到結構變異的數量增加了104%,相對之前翻了一番,這一(yī)數字不僅代表著龐大的數量,還意味著拯救更多生命的可能性。此(cǐ)外,目前的成果還隻(zhī)是人類泛基因組研究的一個(gè)階段性收獲,如(rú)前文所述,研究目標(biāo)是對350人(rén)的遺傳物質進行測序(xù),但截至目前僅完成了47人。

  2010年,6歲(suì)的美國男孩尼古拉斯·沃爾克成為世界上第一個(gè)被基因(yīn)測序技術拯救的兒童。這個男孩患上了嚴重的(de)腸道感(gǎn)染病,經曆了約百(bǎi)次手術(shù)但病因依然無(wú)法確定。最終,醫生們通過基因測序(xù),發現沃(wò)爾克的(de)疾病來自一個罕見的基因突變(biàn)。在此基礎上,沃爾克接受(shòu)了臍帶血細(xì)胞移植(zhí)後終於痊愈。

  除了沃爾克,世界上還有多例被基因技(jì)術治愈的病例,人類參考基因組(zǔ)是這些(xiē)病人得到準確診斷的(de)重要基礎之一。泛基因組測量出來的結構變異不僅使(shǐ)人們對人類基因組遺傳多樣性的理解更加完整,還讓更多患(huàn)者得到了診斷和治療的可能性。

  來自美國加利福尼亞大學聖迭戈分校的研究者指出,基於這些成果(guǒ),人們將更容易(yì)確定促成生理特征或臨床特征變(biàn)異的(de)遺傳因素,並在(zài)此(cǐ)基礎上造福更多人。

  “人類泛(fàn)基(jī)因組的研究進展有助(zhù)於促進全球醫療(liáo)公平(píng)。泛基因(yīn)組吸納了更多(duō)不發(fā)達地區人類個體的樣本(běn),這意味著它比(bǐ)參考基因組更適用於研究和輔助(zhù)應對這(zhè)些人群的疾病。”金鑫說。

  金鑫還強調,泛基因組研究能實現不同人群的遺(yí)傳信息對照,這(zhè)會讓所有參與計劃的人群都從中受益。

  金鑫所在的深圳華大生命科學研究院曾與多國科學家共同發起(qǐ)國際千人基因組計劃,這一計劃與泛(fàn)基因(yīn)組(zǔ)計劃類似,目標都是在參考基因組的(de)基礎上創建(jiàn)一個(gè)全球代表性更(gèng)好的人(rén)類基因組圖譜。

  “中國是個有14億人口的大國,中國人的(de)遺傳多樣性十分豐富。中國學者同樣致力於建立代表性(xìng)更強、更(gèng)多樣化的基因組,為我國乃至世界的基因(yīn)研究與醫療公平作(zuò)出貢獻。目前我國科學界已(yǐ)有不少相關成果發(fā)表,預計近期還會有一係列重要成果問世。”金鑫透露。(科技日報 實習記者(zhě) 孫明源(yuán))


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