發布(bù)時間:2023-06-12 01:58:28
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誰比超級計算機更聰明、高效、緊(jǐn)湊?
“生物計(jì)算”展示出美妙新(xīn)圖景
【科技創新世界潮】
◎本報記者 張夢然(rán)
細菌和超級計算機有什麽區別?區別是細菌更“高級”,因為它有更多的回路和更強的處理能力。
所有生命都在“計算(suàn)”。從(cóng)響應(yīng)化學信號的單個細胞,到(dào)在(zài)特(tè)定環境中(zhōng)航行的複雜生物體,信息處理是生命係統的核心。經過數十年的嚐試,科學家終於開始收集細胞、分子甚至整個生物體,來為人類自己的目的執行計算任務。
從本(běn)質上講,計(jì)算(suàn)機也隻是信息處理器,而且人們越來越(yuè)認識到大自(zì)然擁有豐富的(de)這種能力。最明(míng)顯的例子是複雜生物體(tǐ)的神經係統,它能處理來(lái)自環境(jìng)的大量數據並對各種複雜的行為“下指令”。但即使是最小的細胞,也(yě)充滿了複(fù)雜的生物分子通路,這些通路響應輸入信號,打開和關閉基因、產生化學物質或進行自我組織。
最終,生命中所有令人難以(yǐ)置信的壯舉,都依賴於DNA存儲(chǔ)、複製和傳(chuán)遞遺傳指令的能力。
如何構建一台生物計算機?
生物係統有自身的獨特優勢:更緊湊、能源效率更高、可自我維持和(hé)自我修複,而且特別擅長處理來自自然界的信號。
在過去的20年裏,強大的細胞(bāo)和分子工程工具讓人們終於(yú)能在構建生物計算機領域邁出(chū)一步。
美國(guó)麻省理工(gōng)學院生物合成學家克裏斯托弗·沃伊特說,該方法的核心(xīn)是“生物電路(lù)”,類似(sì)於計算(suàn)機中的電子電路。這些電路涉及各種生物(wù)分子(zǐ)相互作用(yòng)以獲取輸入,並對(duì)其進行(háng)處理以產生不(bú)同的輸出,就像它們的矽對應物一樣。通過編輯支撐(chēng)這些(xiē)過程的遺傳(chuán)指令,人們現在可以重新連接這些電路以執行自然界從未計劃的功能。
2019年,瑞士聯邦理工學院利用CRISPR技術,構建了相當於計算機(jī)中央處理器(CPU)的生(shēng)物等效(xiào)物。這個CPU被插入一個細胞,在那裏(lǐ)它調節不同(tóng)基(jī)因的活動以響應專(zhuān)門設計(jì)的RNA序列,使細胞實現了類似於矽計算機(jī)中的邏輯門(mén)。
印度薩哈核物(wù)理研究所在2021年(nián)更(gèng)進一步,誘使一群大腸杆菌計算簡(jiǎn)單迷宮的(de)解決方案。該(gāi)電路分布在幾個大腸杆菌菌株之間,每個菌株都(dōu)被設計用來解決部分問題。通過(guò)共享信息,該(gāi)電路成功地實現了如何在多個迷宮中導航。
大多數生物係統並不同(tóng)於經典計算機的二進製邏輯,它們也不會像計算機芯片那樣一步步解決問題。它們(men)充滿了重複、奇怪的反(fǎn)饋循環和以不同速度(dù)並排運行的截然(rán)不同的過程。
更怪異的是,生物的計算能力還能完全(quán)脫離其自然環境。瑞典(diǎn)隆德大學科學家正在試驗一種完全不(bú)同的(de)生物計算方法,使用(yòng)由分子馬達驅動的微小蛋白質絲圍繞迷宮推進。迷宮的結構經過精心設計,而細(xì)絲能同時探索所有路線(xiàn)。這意(yì)味著解決更大(dà)的問題不需要更多的時間,隻需要更多的細絲(sī)。
重新設計(jì)生物係統會(huì)帶來什麽?
但美國馬薩諸塞州塔夫茨(cí)大學的邁克爾·萊(lái)文認為(wéi),生命係統已經在生(shēng)物學的各(gè)個層麵展示了令人驚歎的計算壯舉,人們應該將重點從嚐試重(chóng)新設計生物係(xì)統,轉移(yí)到尋找與(yǔ)現有係統交互的方法。
萊文實驗室已經證明,他們可以操縱細胞之間的電通信,幫助它們決定如何以及在哪裏生長。舉個恐怖的例子,這可能讓蝌蚪的內髒上長出眼睛,或讓青蛙長出額外的腿。它並不等同於計算,但團隊認為它代表(biǎo)了如何將自然界預先存在(zài)的(de)電路折射為一個“新目(mù)標”。類似的方(fāng)法可用來解決廣(guǎng)泛的計算任(rèn)務。
此外,真菌計算的深奧領域也正在顯示其應(yīng)用潛力。英國(guó)布(bù)裏斯托爾西英格蘭大學研究顯示,真菌在感知pH值、化學物質、光線、重力和(hé)機(jī)械(xiè)應力等(děng)方麵具有的能力令人印象(xiàng)深刻。它(tā)們似乎使用電活動的尖峰進行交流,這開辟了將它們與傳統電子(zǐ)設備連接的前景。
類器官智能(néng)有多智能?
要探尋生物計算(suàn),離不開人們迄今已知的最強大(dà)計算(suàn)設備:大腦。
當前組織工程(chéng)學的進步意味(wèi)著,科學家們可從幹細胞(bāo)中培育(yù)出相當於微型大腦的複雜神經元簇(cù),也就是“大腦類器官”。與此同時,能將信號傳輸到(dào)腦(nǎo)細胞並能(néng)解碼(mǎ)它們的反(fǎn)應,意(yì)味著人們已經開始試驗類器官的(de)記憶和學習能力。
今年早些時候(hòu),美國約翰斯(sī)·霍普金斯(sī)大學團(tuán)隊概述了“類器官智能(néng)”這一新領域的願景。目標(biāo)與人工智能相反(fǎn):他們不會讓計算機更像(xiàng)大腦(nǎo),而是試圖讓(ràng)腦細胞更像計算機。
初創公(gōng)司Cortical已可訓練在矽芯片上培養的人類腦細胞來玩電子乒乓遊戲Pong。而在它們的新軟件中,任何具有基本編碼技能的人都(dōu)能為“培養皿大腦(nǎo)”編程。
不過,所有這些生物計算方法目前(qián)都遠未成為(wéi)主流(liú)。與設計和製(zhì)造矽芯片的能力相比,人們操縱(zòng)生物學的能力仍處於初(chū)級(jí)階段。但(dàn)生物計算的巨(jù)大潛力和投入生物技術的數十億美元,將在未來幾(jǐ)年為這個領域帶來快(kuài)速進步。